Diff for /loncom/metadata_database/parse_activity_log.pl between versions 1.4 and 1.24

version 1.4, 2004/08/25 15:55:17 version 1.24, 2006/04/08 07:10:10
Line 34 Line 34
 #   2     Activity log does not exist  #   2     Activity log does not exist
 #   3     Unable to connect to database  #   3     Unable to connect to database
 #   4     Unable to create database tables  #   4     Unable to create database tables
 #   5     Unspecified error?  #   5     Unable to open log file
   #   6     Unable to get lock on activity log
 #  #
   
   #
   # Notes:
   #
   # Logging is done via the $logthis variable, which may be the result of 
   # overcleverness.  log via $logthis->('logtext');  Those are parentheses,
   # not curly braces.  If the -log command line parameter is set, the $logthis
   # routine is set to a routine which writes to a file.  If the command line
   # parameter is not set $logthis is set to &nothing, which does what you
   # would expect.
   #
 use strict;  use strict;
 use DBI;  use DBI;
 use lib '/home/httpd/lib/perl/Apache';  use lib '/home/httpd/lib/perl/';
 use lonmysql();  use LONCAPA::Configuration();
   use Apache::lonmysql();
 use Time::HiRes();  use Time::HiRes();
 use Getopt::Long();  use Getopt::Long();
 use IO::File;  use IO::File;
   use File::Copy;
   use Fcntl qw(:flock);
   use HTML::TokeParser;
   
 #  #
 # Determine parameters  # Determine parameters
 my ($help,$course,$domain,$drop,$file,$time_run,$nocleanup,$log);  my ($help,$course,$domain,$drop_when_done,$srcfile,$logfile,$time_run,$nocleanup,$log,$backup,$xmlfile);
 &Getopt::Long::GetOptions( "course=s"  => \$course,  &Getopt::Long::GetOptions( "course=s"  => \$course,
                            "domain=s"  => \$domain,                             "domain=s"  => \$domain,
                              "backup"    => \$backup,
                            "help"      => \$help,                             "help"      => \$help,
                            "logfile=s" => \$file,                             "logfile=s" => \$logfile,
                              "srcfile=s" => \$srcfile,
                              "justloadxml=s" => \$xmlfile,
                            "timerun"   => \$time_run,                             "timerun"   => \$time_run,
                            "nocleanup" => \$nocleanup,                             "nocleanup" => \$nocleanup,
                            "drop"      => \$drop,                             "dropwhendone" => \$drop_when_done,
                            "log"       => \$log);                             "log"       => \$log);
 if (! defined($course) || $help) {  if (! defined($course) || $help) {
     print<<USAGE;      print<<USAGE;
Line 63  parse_activity_log.pl Line 81  parse_activity_log.pl
 Process a lon-capa activity log into a database.  Process a lon-capa activity log into a database.
 Parameters:  Parameters:
    course             Required     course             Required
    domain             Optional     domain             optional
    drop               optional   if present, drop all course      backup             optional   if present, backup the activity log file
                                  specific activity log tables.                                   before processing it
    file               optional   Specify the file to parse, including path     dropwhendone       optional   if present, drop all course 
                                    specific activity log tables after processing.
      srcfile            optional   Specify the file to parse, including path
    time               optional   if present, print out timing data     time               optional   if present, print out timing data
    nocleanup          optional   if present, do not remove old files     nocleanup          optional   if present, do not remove old files
    log                optional   if present, prepare log file of activity     log                optional   if present, prepare log file of activity
      logfile            optional   specifies the logfile to use
 Examples:  Examples:
   $0 -course=123456abcdef -domain=msu    $0 -course=123456abcdef -domain=msu
   $0 -course=123456abcdef -file=activity.log    $0 -course=123456abcdef -srcfile=activity.log
     $0 -course-123456abcdef -log -logfile=/tmp/logfile -dropwhendone
 USAGE  USAGE
     exit;      exit;
 }  }
Line 88  my $initial_time = Time::HiRes::time; Line 110  my $initial_time = Time::HiRes::time;
 ##  ##
 ## Read in configuration parameters  ## Read in configuration parameters
 ##  ##
 my %perlvar;  my %perlvar = %{&LONCAPA::Configuration::read_conf('loncapa.conf')};
 &initialize_configuration();  
 if (! defined($domain) || $domain eq '') {  if (! defined($domain) || $domain eq '') {
     $domain = $perlvar{'lonDefDomain'};      $domain = $perlvar{'lonDefDomain'};
 }  }
Line 98  if (! defined($domain) || $domain eq '') Line 120  if (! defined($domain) || $domain eq '')
 ##  ##
 ## Set up logging code  ## Set up logging code
 my $logthis = \&nothing;  my $logthis = \&nothing;
   
 if ($log) {  if ($log) {
     my $logfile = $perlvar{'lonDaemons'}.'/tmp/parse_activity_log.log.'.time;      if (! $logfile) {
           $logfile = $perlvar{'lonDaemons'}.'/tmp/parse_activity_log.log.'.time;
       }
     print STDERR "$0: logging to $logfile".$/;      print STDERR "$0: logging to $logfile".$/;
     if (! open(LOGFILE,">$logfile")) {      if (! open(LOGFILE,">$logfile")) {
         die "Unable to open $logfile for writing.  Run aborted.";          warn("Unable to open $logfile for writing.  Run aborted.");
           &clean_up_and_exit(5);
     } else {      } else {
         $logthis = \&log_to_file;          $logthis = \&log_to_file;
     }      }
Line 114  if ($log) { Line 140  if ($log) {
 ##  ##
 my $sourcefilename;   # activity log data  my $sourcefilename;   # activity log data
 my $newfilename;      # $sourcefilename will be renamed to this  my $newfilename;      # $sourcefilename will be renamed to this
 my $sql_filename;     # the mysql backup data file name.  
 my $error_filename;   # Errors in parsing the activity log will be written here  my $error_filename;   # Errors in parsing the activity log will be written here
 if ($file) {  my $chunk_filename;   # where we save data we are not going to write to db
     $sourcefilename = $file;  if ($srcfile) {
       $sourcefilename = $srcfile;
 } else {  } else {
     $sourcefilename = &get_filename($course,$domain);      $sourcefilename = &get_filename($course,$domain);
 }  }
 $sql_filename = $sourcefilename;  my $sql_filename = $sourcefilename;
 $sql_filename =~ s|[^/]*$|activity.log.sql|;  $sql_filename =~ s|[^/]*$|activity.log.sql|;
   my $gz_sql_filename = $sql_filename.'.gz';
   #
   $chunk_filename = $sourcefilename.".unprocessed_chunks";
   #
   my $xml_filename = $sourcefilename;
   my $gz_xml_filename = $xml_filename.'.gz';
   if (defined($xmlfile)) {
       $xml_filename = $xmlfile;
       if ($xml_filename =~ /\.gz$/) {
           $gz_xml_filename = $xml_filename;
       } else {
           $gz_xml_filename = $xml_filename.'.gz';
       }
   } else {
       my $xml_filename = $sourcefilename;
       $xml_filename =~ s|[^/]*$|activity.log.xml|;
       $gz_xml_filename = $xml_filename.'.gz';
   }
   #
 $error_filename = $sourcefilename;  $error_filename = $sourcefilename;
 $error_filename =~ s|[^/]*$|activity.log.errors|;  $error_filename =~ s|[^/]*$|activity.log.errors|;
 $logthis->('Beginning logging '.time);  $logthis->('Beginning logging '.time);
   
 ##  #
 ## There will only be a $newfilename file if a copy of this program is already  # Wait for a lock on the lockfile to avoid collisions
 ## running.  my $lockfilename = $sourcefilename.'.lock';
 my $newfilename = $sourcefilename.'.processing';  $newfilename = $sourcefilename.'.processing';
 if (-e $newfilename) {  if (! defined($xmlfile)) {
     warn "$newfilename exists";      open(LOCKFILE,'>'.$lockfilename);
     $logthis->($newfilename.' exists');      if (!flock(LOCKFILE,LOCK_EX|LOCK_NB)) {
     exit 2;          warn("Unable to lock $lockfilename.  Aborting".$/);
 }          # don't call clean_up_and_exit another instance is running and
           # we don't want to 'cleanup' their files
 if (-e $sourcefilename) {          exit 6;
     $logthis->('renaming '.$sourcefilename.' to '.$newfilename);      }
     rename($sourcefilename,$newfilename);  
     $logthis->("renamed $sourcefilename to $newfilename");      if (! -e $newfilename && -e $sourcefilename) {
 } else {          $logthis->('renaming '.$sourcefilename.' to '.$newfilename);
     my $command = 'touch '.$newfilename;          rename($sourcefilename,$newfilename);
     $logthis->($command);          Copy($newfilename,$newfilename.'.'.time) if ($backup);
     system($command);          $logthis->("renamed $sourcefilename to $newfilename");
     $logthis->('touch was completed');      } elsif (! -e $newfilename) {
           utime(undef,undef,$newfilename);
       }
 }  }
   
 ##  ##
 ## Table definitions  ## Table definitions
 ##  ##
 my $prefix = $course.'_'.$domain.'_';  my %tables = &table_names($course,$domain);
 my $student_table = $prefix.'students';  
 my $student_table_def =   my $student_table_def = 
 { id => $student_table,  { id => $tables{'student'},
   permanent => 'no',    permanent => 'no',
   columns => [    columns => [
               { name => 'student_id',                { name => 'student_id',
Line 168  my $student_table_def = Line 214  my $student_table_def =
       'PRIMARY KEY' => ['student_id',],        'PRIMARY KEY' => ['student_id',],
           };            };
   
 my $res_table = $prefix.'resource';  
 my $res_table_def =   my $res_table_def = 
 { id => $res_table,  { id => $tables{'res'},
   permanent => 'no',    permanent => 'no',
   columns => [{ name => 'res_id',    columns => [{ name => 'res_id',
                 type => 'MEDIUMINT UNSIGNED',                  type => 'MEDIUMINT UNSIGNED',
Line 183  my $res_table_def = Line 228  my $res_table_def =
   'PRIMARY KEY' => ['res_id'],    'PRIMARY KEY' => ['res_id'],
 };  };
   
 #my $action_table = $prefix.'actions';  
 #my $action_table_def =  #my $action_table_def =
 #{ id => $action_table,  #{ id => $action_table,
 #  permanent => 'no',  #  permanent => 'no',
Line 198  my $res_table_def = Line 242  my $res_table_def =
 #  'PRIMARY KEY' => ['action_id',],   #  'PRIMARY KEY' => ['action_id',], 
 #};  #};
   
 my $machine_table = $prefix.'machine_table';  
 my $machine_table_def =  my $machine_table_def =
 { id => $machine_table,  { id => $tables{'machine'},
   permanent => 'no',    permanent => 'no',
   columns => [{ name => 'machine_id',    columns => [{ name => 'machine_id',
                 type => 'MEDIUMINT UNSIGNED',                  type => 'MEDIUMINT UNSIGNED',
Line 213  my $machine_table_def = Line 256  my $machine_table_def =
   'PRIMARY KEY' => ['machine_id',],    'PRIMARY KEY' => ['machine_id',],
  };   };
   
 my $activity_table = $prefix.'activity';  
 my $activity_table_def =   my $activity_table_def = 
 { id => $activity_table,  { id => $tables{'activity'},
   permanent => 'no',    permanent => 'no',
   columns => [    columns => [
               { name => 'res_id',                { name => 'res_id',
Line 244  my $activity_table_def = Line 286  my $activity_table_def =
       'KEY' => [{columns => ['student_id']},        'KEY' => [{columns => ['student_id']},
                 {columns => ['time']},],                  {columns => ['time']},],
 };  };
 my @Activity_Table = ($activity_table_def);   
   
 #my @ID_Tables = ($student_table_def,$res_table_def,  
 #                 $action_table_def,$machine_table_def);  
   
   my @Activity_Table = ($activity_table_def);
 my @ID_Tables = ($student_table_def,$res_table_def,$machine_table_def);  my @ID_Tables = ($student_table_def,$res_table_def,$machine_table_def);
                                        
   
 ##  ##
 ## End of table definitions  ## End of table definitions
 ##  ##
   $logthis->('tables = '.join(',',keys(%tables)));
   
 #   
 $logthis->('Connectiong to mysql');  $logthis->('Connectiong to mysql');
 &Apache::lonmysql::set_mysql_user_and_password($perlvar{'lonSqlUser'},  &Apache::lonmysql::set_mysql_user_and_password('www',
                                                $perlvar{'lonSqlAccess'});                                                 $perlvar{'lonSqlAccess'});
 if (!&Apache::lonmysql::verify_sql_connection()) {  if (!&Apache::lonmysql::verify_sql_connection()) {
     warn "Unable to connect to MySQL database.";      warn "Unable to connect to MySQL database.";
     $logthis->("Unable to connect to MySQL database.");      $logthis->("Unable to connect to MySQL database.");
     exit 3;      &clean_up_and_exit(3);
 }  }
   
 $logthis->('SQL connection is up');  $logthis->('SQL connection is up');
   
 if ($drop) { &drop_tables(); $logthis->('dropped tables'); }  &update_process_name($course.'@'.$domain." loading existing data");
   my $missing_table = &check_for_missing_tables(values(%tables));
 if (-s $sql_filename) {  if (-s $gz_sql_filename && ! -s $gz_xml_filename) {
     # if ANY one of the tables does not exist, load the tables from the      my $backup_modification_time = (stat($gz_sql_filename))[9];
     # backup.      $logthis->($gz_sql_filename.' was last modified '.
     my @Current_Tables = &Apache::lonmysql::tables_in_db();                 localtime($backup_modification_time).
     my %Found;                 '('.$backup_modification_time.')');
     foreach my $tablename (@Current_Tables) {      if ($missing_table) {
         foreach my $table (@Activity_Table,@ID_Tables) {          # If the backup happened prior to the last table modification,
             if ($tablename eq  $table->{'id'}) {          # we need to save the tables.
                 $Found{$tablename}++;          if (&latest_table_modification_time() > $backup_modification_time) {
             }              # Save the current tables in case we need them another time.
               $logthis->('Backing existing tables up');
               &backup_tables_as_xml($gz_xml_filename.'.save_'.time,\%tables);
         }          }
     }          $time_this->();
     foreach my $table (@Activity_Table,@ID_Tables) {              &load_backup_sql_tables($gz_sql_filename);
         if (! $Found{$table->{'id'}}) {          &backup_tables_as_xml($gz_xml_filename,\%tables);
             $time_this->();          $time_this->('load backup tables');
             &load_backup_tables($sql_filename);      }
             $time_this->('load backup tables');  } elsif (-s $gz_xml_filename) {
             last;      my $backup_modification_time = (stat($gz_xml_filename))[9];
       $logthis->($gz_xml_filename.' was last modified '.
                  localtime($backup_modification_time).
                  '('.$backup_modification_time.')');
       if ($missing_table) {
           my $table_modification_time = $backup_modification_time;
           # If the backup happened prior to the last table modification,
           # we need to save the tables.
           if (&latest_table_modification_time() > $backup_modification_time) {
               # Save the current tables in case we need them another time.
               $logthis->('Backing existing tables up');
               &backup_tables_as_xml($gz_xml_filename.'.save_'.time,\%tables);
         }          }
     }          $time_this->();
           # We have to make our own tables for the xml format
           &drop_tables();
           &create_tables();
           &load_backup_xml_tables($gz_xml_filename,\%tables);
           $time_this->('load backup tables');
       }    
   }
   
   if (defined($xmlfile)) {
       &clean_up_and_exit(0);
 }  }
   
 ##  ##
Line 299  $logthis->('creating tables'); Line 359  $logthis->('creating tables');
 if (! &create_tables()) {  if (! &create_tables()) {
     warn "Unable to create tables";      warn "Unable to create tables";
     $logthis->('Unable to create tables');      $logthis->('Unable to create tables');
     exit 4;      &clean_up_and_exit(4);
 }  }
   
 ##  ##
Line 315  my $error_fh = IO::File->new(">>$error_f Line 375  my $error_fh = IO::File->new(">>$error_f
 ##  ##
 ## Parse the course log  ## Parse the course log
 $logthis->('processing course log');  $logthis->('processing course log');
   &update_process_name($course.'@'.$domain." processing new data");
 if (-s $newfilename) {  if (-s $newfilename) {
     my $result = &process_courselog($newfilename,$error_fh);      my $result = &process_courselog($newfilename,$error_fh,\%tables);
       &update_process_name($course.'@'.$domain." backing up new data");
     if (! defined($result)) {      if (! defined($result)) {
         # Something went wrong along the way...          # Something went wrong along the way...
         $logthis->('process_courselog returned undef');          $logthis->('process_courselog returned undef');
         exit 5;          &clean_up_and_exit(5);
     } elsif ($result > 0) {      } elsif ($result > 0) {
         $time_this->();          $time_this->();
         $logthis->('process_courselog returned '.$result.' backup up tables');          $logthis->('process_courselog returned '.$result.'.'.$/.
         &backup_tables($sql_filename);                     'Backing up tables');
           &backup_tables_as_xml($gz_xml_filename,\%tables);
         $time_this->('write backup tables');          $time_this->('write backup tables');
     }      }
       if ($drop_when_done) { &drop_tables(); $logthis->('dropped tables'); }
 }  }
 close($error_fh);  close($error_fh);
   
Line 346  if ($time_run) { Line 410  if ($time_run) {
     $logthis->(&outputtimes());      $logthis->(&outputtimes());
 }  }
   
 if ($log) {  &clean_up_and_exit(0);
     close LOGFILE;  
   ########################################################
   ########################################################
   
   sub clean_up_and_exit {
       my ($exit_code) = @_;
       # Close files
       close(LOCKFILE);
       close(LOGFILE);
       # Remove zero length files
       foreach my $file ($lockfilename, $error_filename,$logfile) {
           if (defined($file) && -z $file) { 
               unlink($file); 
           }
       }
   
       exit $exit_code;
 }  }
   
 exit 0;   # Everything is okay, so end here before it gets worse.  ########################################################
   ########################################################
   sub table_names {
       my ($course,$domain) = @_;
       my $prefix = $course.'_'.$domain.'_';
       #
       my %tables = 
           ( student =>&Apache::lonmysql::fix_table_name($prefix.'students'),
             res     =>&Apache::lonmysql::fix_table_name($prefix.'resource'),
             machine =>&Apache::lonmysql::fix_table_name($prefix.'machine_table'),
             activity=>&Apache::lonmysql::fix_table_name($prefix.'activity'),
             );
       return %tables;
   }
   
 ########################################################  ########################################################
 ########################################################  ########################################################
Line 362  exit 0;   # Everything is okay, so end h Line 455  exit 0;   # Everything is okay, so end h
 #  #
 # Returns the number of lines in the activity.log file that were processed.  # Returns the number of lines in the activity.log file that were processed.
 sub process_courselog {  sub process_courselog {
     my ($inputfile,$error_fh) = @_;      my ($inputfile,$error_fh,$tables) = @_;
     if (! open(IN,$inputfile)) {      if (! open(IN,$inputfile)) {
         warn "Unable to open '$inputfile' for reading";          warn "Unable to open '$inputfile' for reading";
         $logthis->("Unable to open '$inputfile' for reading");          $logthis->("Unable to open '$inputfile' for reading");
Line 371  sub process_courselog { Line 464  sub process_courselog {
     my ($linecount,$insertcount);      my ($linecount,$insertcount);
     my $dbh = &Apache::lonmysql::get_dbh();      my $dbh = &Apache::lonmysql::get_dbh();
     #      #
     # Timing variables      &store_entry();
     my @RowData;  
     while (my $line=<IN>){      while (my $line=<IN>){
         # last if ($linecount > 1000);          # last if ($linecount > 1000);
         #          #
Line 382  sub process_courselog { Line 474  sub process_courselog {
         $linecount++;          $linecount++;
         # print $linecount++.$/;          # print $linecount++.$/;
         my ($timestamp,$host,$log)=split(/\:/,$line,3);          my ($timestamp,$host,$log)=split(/\:/,$line,3);
         $time_this->('splitline');  
         #          #
         # $log has the actual log entries; currently still escaped, and          # $log has the actual log entries; currently still escaped, and
         # %26(timestamp)%3a(url)%3a(user)%3a(domain)          # %26(timestamp)%3a(url)%3a(user)%3a(domain)
Line 394  sub process_courselog { Line 485  sub process_courselog {
         # get delimiter between timestamped entries to be &&&          # get delimiter between timestamped entries to be &&&
         $log=~s/\%26(\d{9,10})\%3a/\&\&\&$1\%3a/g;          $log=~s/\%26(\d{9,10})\%3a/\&\&\&$1\%3a/g;
         $log = &unescape($log);          $log = &unescape($log);
         $time_this->('translate_and_unescape');  
         # now go over all log entries           # now go over all log entries 
         if (! defined($host)) { $host = 'unknown'; }          if (! defined($host)) { $host = 'unknown'; }
         my $machine_id = &get_id($machine_table,'machine',$host);  
         my $prevchunk = 'none';          my $prevchunk = 'none';
         foreach my $chunk (split(/\&\&\&/,$log)) {          foreach my $chunk (split(/\&\&\&/,$log)) {
               if (length($chunk) > 20000) {
                   # avoid putting too much data into the database
                   # (usually an uploaded file or something similar)
                   if (! &savechunk(\$chunk,$timestamp,$host)) {
                       close(IN);
                       return undef;
                   }
                   next;
               }
             my $warningflag = '';              my $warningflag = '';
             $time_this->();  
     my ($time,$res,$uname,$udom,$action,@values)= split(/:/,$chunk);      my ($time,$res,$uname,$udom,$action,@values)= split(/:/,$chunk);
             my $student = $uname.':'.$udom;              #
             if (! defined($res) || $res =~ /^\s*$/) {              if (! defined($res) || $res =~ /^\s*$/) {
                 $res = '/adm/roles';                  $res = '/adm/roles';
                 $action = 'LOGIN';                  $action = 'LOGIN';
Line 417  sub process_courselog { Line 514  sub process_courselog {
             if ($action !~ /^(LOGIN|VIEW|POST|CSTORE|STORE)$/) {              if ($action !~ /^(LOGIN|VIEW|POST|CSTORE|STORE)$/) {
                 $warningflag .= 'action';                  $warningflag .= 'action';
                 print $error_fh 'full log entry:'.$log.$/;                  print $error_fh 'full log entry:'.$log.$/;
                 print $error_fh 'error on chunk:'.$chunk.$/;                  print $error_fh 'error on chunk (saving)'.$/;
                 $logthis->('(action) Unable to parse '.$/.$chunk.$/.                  if (! &savechunk(\$chunk,$timestamp,$host)) {
                       close(IN);
                       return undef;
                   }
                   $logthis->('(action) Unable to parse chunk'.$/.
                          'got '.                           'got '.
                          'time = '.$time.$/.                           'time = '.$time.$/.
                          'res  = '.$res.$/.                           'res  = '.$res.$/.
                          'uname= '.$uname.$/.                           'uname= '.$uname.$/.
                          'udom = '.$udom.$/.                           'udom = '.$udom.$/.
                          'action='.$action.$/.                           'action='.$action.$/.
                          '@values = '.join(':',@values));                           '@values = '.join('&',@values));
                 next; #skip it if we cannot understand what is happening.                  next; #skip it if we cannot understand what is happening.
             }              }
             if (! defined($student) || $student eq ':') {  
                 $student = 'unknown';  
                 $warningflag .= 'student';  
             }  
             if (! defined($res) || $res =~ /^\s*$/) {  
                 $res = 'unknown';  
                 $warningflag .= 'res';  
             }  
             if (! defined($action) || $action =~ /^\s*$/) {  
                 $action = 'unknown';  
                 $warningflag .= 'action';  
             }  
             if (! defined($time) || $time !~ /^\d+$/) {  
                 $time = 0;  
                 $warningflag .= 'time';  
             }  
             #  
             $time_this->('split_and_error_check');  
             my $student_id = &get_id($student_table,'student',$student);  
             my $res_id     = &get_id($res_table,'resource',$res);  
 #            my $action_id  = &get_id($action_table,'action',$action);  
             my $sql_time   = &Apache::lonmysql::sqltime($time);  
             #              #
             if (! defined($student_id) || $student_id eq '') {               my %data = (student  => $uname.':'.$udom,
                 $warningflag.='student_id';                           resource => $res,
             }                          machine  => $host,
             if (! defined($res_id) || $res_id eq '') {                           action   => $action,
                 $warningflag.='res_id';                           time => &Apache::lonmysql::sqltime($time));
             }              if ($action eq 'POST') {
 #            if (! defined($action_id) || $action_id eq '') {                   $data{'action_values'} =
 #                $warningflag.='action_id';                       $dbh->quote(join('&',map { &escape($_); } @values));
 #            }              } else {
             if ($warningflag ne '') {                  $data{'action_values'} = $dbh->quote(join('&',@values));
                 print $error_fh 'full log entry:'.$log.$/;              }
                 print $error_fh 'error on chunk:'.$chunk.$/;              my $error = &store_entry($dbh,$tables,\%data);
                 $logthis->('warningflag ('.$warningflag.') on chunk '.              if ($error) {
                            $/.$chunk.$/.'prevchunk = '.$/.$prevchunk);                  $logthis->('error store_entry:'.$error." on %data");
                 $prevchunk .= $chunk;  
                 next; # skip this chunk  
             }              }
             #  
             my $values = $dbh->quote(join('',@values));  
             $time_this->('get_ids');  
             #  
             my $row = [$res_id,  
                        qq{'$sql_time'},  
                        $student_id,  
                        "'".$action."'",  
 #                       $action_id,  
                        qq{''},        # idx  
                        $machine_id,  
                        $values];  
             push(@RowData,$row);  
             $time_this->('push_row');  
             $prevchunk = $chunk;              $prevchunk = $chunk;
             #  
         }  
         $time_this->();  
         if ((scalar(@RowData) > 0) && ($linecount % 100 == 0)) {  
             my $result = &Apache::lonmysql::bulk_store_rows($activity_table,  
                                                             undef,  
                                                             \@RowData);  
             # $logthis->('result = '.$result);  
             $time_this->('bulk_store_rows');  
             if (! defined($result)) {  
                 my $error = &Apache::lonmysql::get_error();  
                 warn "Error occured during insert.".$error;  
                 $logthis->('error = '.$error);  
             }  
             undef(@RowData);  
         }          }
     }      }
     if (@RowData) {      my $result = &store_entry($dbh,$tables);
         $time_this->();      if (! defined($result)) {
         $logthis->('storing '.$linecount);          my $error = &Apache::lonmysql::get_error();
         my $result = &Apache::lonmysql::bulk_store_rows($activity_table,          warn "Error occured during insert.".$error;
                                                         undef,          $logthis->('error = '.$error);
                                                         \@RowData);  
         $logthis->('result = '.$result);  
         $time_this->('bulk_store_rows');  
         if (! defined($result)) {  
             my $error = &Apache::lonmysql::get_error();  
             warn "Error occured during insert.".$error;  
             $logthis->('error = '.$error);  
         }  
         undef(@RowData);  
     }      }
     close IN;      close IN;
 #    print "Number of lines: ".$linecount.$/;  
 #    print "Number of inserts: ".$insertcount.$/;  
     return $linecount;      return $linecount;
       ##
       ##
       sub savechunk {
           my ($chunkref,$timestamp,$host) = @_;
           my $chunk = &escape(${$chunkref});
           if (! open(CHUNKFILE,">>$chunk_filename") ||
               ! print CHUNKFILE $timestamp.':'.$host.':'.$chunk.$/) {
               # abort
               close(CHUNKFILE);
               return 0;
           }
           close(CHUNKFILE);
           return 1;
       }
 }  }
   
   
 ##  ##
 ## Somtimes, instead of doing something, doing nothing is appropriate.  ## default value for $logthis and $time_this
 sub nothing {  sub nothing {
     return;      return;
 }  }
   
 ##  ##
 ## Logging routine  ## Logging routine (look for $log)
 ##  ##
 sub log_to_file {  sub log_to_file {
     my ($input)=@_;      my ($input)=@_;
Line 570  sub outputtimes { Line 621  sub outputtimes {
   
 }  }
   
   sub latest_table_modification_time {
       my $latest_time;
       foreach my $table (@Activity_Table,@ID_Tables) {    
           my %tabledata = &Apache::lonmysql::table_information($table->{'id'});
           next if (! scalar(keys(%tabledata))); # table does not exist
           if (! defined($latest_time) ||
               $latest_time < $tabledata{'Update_time'}) {
               $latest_time = $tabledata{'Update_time'};
           }
       }
       return $latest_time;
   }
   
   sub check_for_missing_tables {
       my @wanted_tables = @_;
       # Check for missing tables
       my @Current_Tables = &Apache::lonmysql::tables_in_db();
       my %Found;
       foreach my $tablename (@Current_Tables) {
           foreach my $table (@wanted_tables) {
               if ($tablename eq  $table) {
                   $Found{$tablename}++;
               }
           }
       }
       $logthis->('Found tables '.join(',',keys(%Found)));
       my $missing_a_table = 0;
       foreach my $table (@wanted_tables) {
           if (! $Found{$table}) {
               $logthis->('Missing table '.$table);
               $missing_a_table = 1;
               last;
           }
       }
       return $missing_a_table;
   }
   
 ##  ##
 ## Use mysqldump to store backups of the tables  ## Use mysqldump to store backups of the tables
 ##  ##
 sub backup_tables {  sub backup_tables_as_sql {
     my ($sql_filename) = @_;      my ($gz_sql_filename) = @_;
     my $command = qq{mysqldump --opt loncapa };      my $command = qq{mysqldump --quote-names --opt loncapa };
                                
     foreach my $table (@ID_Tables,@Activity_Table) {      foreach my $table (@ID_Tables,@Activity_Table) {
         my $tablename = $table->{'id'};          my $tablename = $table->{'id'};
           $tablename =~ s/\`//g;
         $command .= $tablename.' ';          $command .= $tablename.' ';
     }      }
     $command .= '>'.$sql_filename;      $command .= '| gzip >'.$gz_sql_filename;
     $logthis->($command);      $logthis->($command);
     system($command);      system($command);
 }  }
Line 590  sub backup_tables { Line 677  sub backup_tables {
 ##  ##
 ## Load in mysqldumped files  ## Load in mysqldumped files
 ##  ##
 sub load_backup_tables {  sub load_backup_sql_tables {
     my ($sql_filename) = @_;      my ($gz_sql_filename) = @_;
     return undef if (! -e $sql_filename);      if (-s $gz_sql_filename) {
     # Check for .my.cnf          $logthis->('loading data from gzipped sql file');
     my $command = 'mysql -e "SOURCE '.$sql_filename.'" loncapa';          my $command='gzip -dc '.$gz_sql_filename.' | mysql --database=loncapa';
     $logthis->('loading previously saved sql table'.$/.$command);          system($command);
     system($command);          $logthis->('finished loading gzipped data');;
     $logthis->('finished loading old data');      } else {
           return undef;
       }
 }  }
   
 ##  ##
 ##   ## 
 ##  ##
 sub initialize_configuration {  
     # Fake it for now:  
     $perlvar{'lonSqlUser'} = 'www';  
     $perlvar{'lonSqlAccess'} = 'localhostkey';  
     $perlvar{'lonUsersDir'} = '/home/httpd/lonUsers';  
     $perlvar{'lonDefDomain'} = '103';  
 }  
   
 sub update_process_name {  sub update_process_name {
     my ($text) = @_;      my ($text) = @_;
     $0 = 'parse_activity_log.pl: '.$text;      $0 = 'parse_activity_log.pl: '.$text;
Line 625  sub get_filename { Line 706  sub get_filename {
 sub create_tables {  sub create_tables {
     foreach my $table (@ID_Tables,@Activity_Table) {      foreach my $table (@ID_Tables,@Activity_Table) {
         my $table_id = &Apache::lonmysql::create_table($table);          my $table_id = &Apache::lonmysql::create_table($table);
 #        print STDERR "Unable to create table ".$table->{'id'}.$/;  
 #        print STDERR join($/,&Apache::lonmysql::build_table_creation_request($table)).$/;  
         if (! defined($table_id)) {          if (! defined($table_id)) {
             warn "Unable to create table ".$table->{'id'}.$/;              warn "Unable to create table ".$table->{'id'}.$/;
             warn join($/,&Apache::lonmysql::build_table_creation_request($table)).$/;              $logthis->('Unable to create table '.$table->{'id'});
               $logthis->(join($/,&Apache::lonmysql::build_table_creation_request($table)));
             return 0;              return 0;
         }          }
     }      }
Line 666  sub read_id_tables { Line 746  sub read_id_tables {
   
 sub get_id {  sub get_id {
     my ($table,$fieldname,$value) = @_;      my ($table,$fieldname,$value) = @_;
     if (exists($IDs{$table}->{$value})) {      if (exists($IDs{$table}->{$value}) && $IDs{$table}->{$value} =~ /^\d+$/) {
         return $IDs{$table}->{$value};          return $IDs{$table}->{$value};
     } else {      } else {
         # insert into the table - if the item already exists, that is          # insert into the table - if the item already exists, that is
         # okay.          # okay.
         my $result = &Apache::lonmysql::store_row($table,[undef,$value]);          my $result = &Apache::lonmysql::store_row($table,[undef,$value]);
         if (! defined($result)) {          if (! defined($result)) {
             warn("Got error on id insert for $value\n".&Apache::lonmysql::get_error());              warn("Got error on id insert for $value\n".
                    &Apache::lonmysql::get_error());
         }          }
         # get the id          # get the id
         my @Data =           my $id = &Apache::lonmysql::get_dbh()->{'mysql_insertid'};
             &Apache::lonmysql::get_rows($table,qq{$fieldname='$value'});          if (defined($id)) {
         if (@Data) {              $IDs{$table}->{$value}=$id;
             $IDs{$table}->{$value}=$Data[0]->[0];  
             return $IDs{$table}->{$value};  
         } else {          } else {
             $logthis->("Unable to retrieve id for $table $fieldname $value");              $logthis->("Unable to retrieve id for $table $fieldname $value");
             return undef;              return undef;
Line 690  sub get_id { Line 769  sub get_id {
   
 } # End of ID scoping  } # End of ID scoping
   
   ###############################################################
   ###############################################################
   ##
   ##   Save as XML
   ##
   ###############################################################
   ###############################################################
   sub backup_tables_as_xml {
       my ($filename,$tables) = @_;
       open(XMLFILE,"|gzip - > $filename") || return ('error:unable to write '.$filename);
       my $query = qq{
           SELECT B.resource,
                  A.time,
                  A.idx,
                  C.student,
                  A.action,
                  E.machine,
                  A.action_values 
               FROM $tables->{'activity'} AS A
               LEFT JOIN $tables->{'res'}      AS B ON B.res_id=A.res_id 
               LEFT JOIN $tables->{'student'}  AS C ON C.student_id=A.student_id 
               LEFT JOIN $tables->{'machine'}  AS E ON E.machine_id=A.machine_id
               ORDER BY A.time DESC
           };
       $query =~ s/\s+/ /g;
       my $dbh = &Apache::lonmysql::get_dbh();
       my $sth = $dbh->prepare($query);
       if (! $sth->execute()) {
           $logthis->('<font color="blue">'.
                      'WARNING: Could not retrieve from database:'.
                      $sth->errstr().'</font>');
           return undef;
       } else {
           my ($res,$sqltime,$idx,$student,$action,$machine,$action_values);
           if ($sth->bind_columns(\$res,\$sqltime,\$idx,\$student,\$action,
                                  \$machine,\$action_values)) {
               
               while ($sth->fetch) {
                   print XMLFILE '<row>'.
                       qq{<resource>$res</resource>}.
                       qq{<time>$sqltime</time>}.
                       qq{<idx>$idx</idx>}.
                       qq{<student>$student</student>}.
                       qq{<action>$action</action>}.
                       qq{<machine>$machine</machine>}.
                       qq{<action_values>$action_values</action_values>}.
                       '</row>'.$/;
               }
           } else {
               warn "Unable to bind to columns.\n";
               return undef;
           }
       }
       close XMLFILE;
       return;
   }
   
   ###############################################################
   ###############################################################
   ##
   ##   load as xml
   ##
   ###############################################################
   ###############################################################
   {
       my @fields = ('resource','time',
                     'student','action','idx','machine','action_values');
       my %ids = ();
   sub load_backup_xml_tables {
       my ($filename,$tables) = @_;
       my $dbh = &Apache::lonmysql::get_dbh();
       my $xmlfh;
       open($xmlfh,"cat $filename | gzip -d - |");
       if (! defined($xmlfh)) {
           return ('error:unable to read '.$filename);
       }
       #
       %ids = (resource=> {"\0count"=>1},
               student=> {"\0count"=>1},
               machine=> {"\0count"=>1});
       #
       my %data;
       while (my $inputline = <$xmlfh>) {
           my ($resource,$time,undef,$student,$action,$machine,$action_values) = 
               ($inputline =~ m{<row>
                                    <resource>(.*)</resource>
                                    <time>(.*)</time>
                                    <idx>(.*)</idx>
                                    <student>(.*)</student>
                                    <action>(.*)</action>
                                    <machine>(.*)</machine>
                                    <action_values>(.*)</action_values>
                                    </row>$
                                }x
                );
           my $resource_id = &xml_get_id('resource',$resource);
           my $student_id  = &xml_get_id('student',$student);
           my $machine_id  = &xml_get_id('machine',$machine);
           &xml_store_activity_row(map { defined($_)?$dbh->quote($_):'' 
                                     } ($resource_id,
                                        $time,
                                        $student_id,
                                        $action,
                                        'NULL',
                                        $machine_id,
                                        $action_values));
       }
       &xml_store_activity_row();
       close($xmlfh);
       # Store id tables
       while (my ($id_name,$id_data) = each(%ids)) {
           if ($id_name eq 'resource') { $id_name = 'res'; }
           delete($id_data->{"\0count"});
           &xml_store_id_table($id_name,$id_data);
       }
       return;
   }
   
   sub xml_get_id {
       my ($table,$element) = @_;
       if (! exists($ids{$table}->{$element})) {
           $ids{$table}->{$element} = $ids{$table}->{"\0count"}++;
       }
       return $ids{$table}->{$element};
   }
   
   {
       my @data_rows;
   sub xml_store_activity_row {
       my @data = @_;
       if (scalar(@data)) {
           push(@data_rows,[@data]);
       }
       if (! scalar(@data) || scalar(@data_rows) > 500) {
           if (! &Apache::lonmysql::bulk_store_rows($tables{'activity'},
                                                    scalar(@{$data_rows[0]}),
                                                    \@data_rows)) {
               $logthis->("Error:".&Apache::lonmysql::get_error());
               warn("Error:".&Apache::lonmysql::get_error());
           } else {
               undef(@data_rows);
           }
       }
       return;
   }
   
   }
   
   sub xml_store_id_table {
       my ($table,$tabledata) =@_;
       my $dbh = &Apache::lonmysql::get_dbh();
       if (! &Apache::lonmysql::bulk_store_rows
           ($tables{$table},2,
            [map{[$tabledata->{$_},$dbh->quote($_)]} keys(%$tabledata)])) {
           $logthis->("Error:".&Apache::lonmysql::get_error());
           warn "Error:".&Apache::lonmysql::get_error().$/;
       }
   }
   
   } # End of load xml scoping
   
   #######################################################################
   #######################################################################
   ##
   ## store_entry - accumulate data to be inserted into the database
   ##
   ## Pass no values in to clear accumulator
   ## Pass ($dbh,\%tables) to initiate storage of values
   ## Pass ($dbh,\%tables,\%data) to use normally
   ##
   #######################################################################
   #######################################################################
   {
       my @rows;
   
   sub store_entry {
       my $max_row_count = 100;
       if (! @_) {
           undef(@rows);
           return '';
       }
       my ($dbh,$tables,$data) = @_;
       return if (! defined($tables));
       if (defined($data)) {
           my $error;
           foreach my $field ('student','resource','action','time') {
               if (! defined($data->{$field}) || $data->{$field} eq ':' ||
                   $data->{$field}=~ /^\s*$/) {
                   $error.=$field.',';
               }
           }
           if ($error) { $error=~s/,$//; return $error; }
           #
           my $student_id = &get_id($tables->{'student'},'student',
                                    $data->{'student'});
           my $res_id     = &get_id($tables->{'res'},
                                    'resource',$data->{'resource'});
           my $machine_id = &get_id($tables->{'machine'},
                                    'machine',$data->{'machine'});
           my $idx = $data->{'idx'}; if (! $idx) { $idx = "''"; }
           #
           push(@rows,[$res_id,
                       qq{'$data->{'time'}'},
                       $student_id,
                       qq{'$data->{'action'}'},
                       $idx,
                       $machine_id,
                       $data->{'action_values'}]);
       }
       if (defined($tables) &&
           ( (! defined($data) && scalar(@rows)) || scalar(@rows)>$max_row_count)
           ){
           # Store the rows
           my $result =
               &Apache::lonmysql::bulk_store_rows($tables->{'activity'},
                                                  undef,
                                                  \@rows);
           if (! defined($result)) {
               my $error = &Apache::lonmysql::get_error();
               warn "Error occured during insert.".$error;
               return $error;
           }
           undef(@rows);
           return $result if (! defined($data));
       }
       return '';
   }
   
   } # end of scope for &store_entry
   
 ###############################################################  ###############################################################
 ###############################################################  ###############################################################

Removed from v.1.4  
changed lines
  Added in v.1.24


FreeBSD-CVSweb <freebsd-cvsweb@FreeBSD.org>